Genomatix Genome Analyzer、Genomatix Mining Stationは高速シーケンサーから得られる巨大なデータをストレス無く、高速にデータ解析するシステムです。この2製品を組み合わせて利用することで、タグのマッピングなどの基礎解析から、Genotype解析、トランスクリプトーム、制御因子解析、エピジェネティクス解析などの、二次解析まで様々な解析が可能です。

Genomatix システムの特長

• 高速マッピング・クラスタリング
  100万bp/分でゲノムにマッピング、2000万リードを約1分でクラスタリング
• トランスクリプトーム・ChIP-Seq・Genotypeなどあらゆる解析が可能
  クラスタリング・転写因子結合予測など様々な解析アプリケーション
• 直観的なインターフェース
  コマンドライン・ウェブブラウズの両方が使用可能
• マルチプラットホームに対応
  illumina ・ABI ・Roche ・Helicosの全機種に対応

Genomatix システムはトランスクリプトーム・ChIP-Seq・Genotypeなど様々な解析にご利用いただけます。

トランスクリプトーム解析

トランスクリプトの発現定量：

クラスタリング結果から遺伝子名、トランスクリプト、発現量のリストが得られます。
GO解析、Tissue解析も可能です。

スプライシングバリアント解析・新規トランスクリプトの同定：

既存アノテーションで、イントロンや、intergenicな領域に位置するクラスタから新規トランスクリプト・バリアントの候補が検出できます。
複数の公共DBや、独自に計算、キュレーションしたトランスクリプト、プロモーター、転写開始点の豊富なアノテーションに対して、解析を行います。

ChIP-Seq解析

Genotype解析

新規SNPsの同定：

マッピング結果から既存SNPsと新規SNPs候補の判別が簡単に行えます。

関連SNPsの同定：

SNPsの転写因子結合サイトへの影響、 アミノ酸の置換を参照、予測します。