Lhasa Limitedは、英国University of Leeds, Department of Chemistryより1983年に設立された非営利団体であり、創薬・化学の分野におけるソフトウェアを開発し、Lhasaメンバー(Lhasa製品のユーザであり、ソフトウェア開発に参加)に提供することによって、国際的に毒性や代謝に関する知見の情報共有を図ることを目的としています。
Derek for Windows は化合物の構造からその毒性を予測する知識ベース(Knowledge Base)のエキスパートシステムです。
Derek for Windowsは他の毒性予測プログラムの様に、統計解析的な手法を用いた定量的毒性予測ではなく、多くの知見から得られた部分構造活性相関(SAR)の経験則をルール化した知識ベースにより、定性的毒性予測を行います。
化合物の構造をISIS/DrawまたはMol・SDファイルからインポートすることで、容易な操作により毒性予測が可能です。 同時に、その毒性予測の根拠になった構造部位をカラーで提示します。
また、構造活性相関に関するリファレンスや既知の例証化合物も参照することができます。
毒性予測を行う化合物の構造入力
Derek for Windowsの機能
Derek for Windowsで用いられる知識ベースは、毒性のある化合物から共通のルールを導き出し作成されています。知識ベースの内容はユーザに公開されており、現在637種のルール(Alert)が収録されています。以下に、予測可能な毒性Endpointの一例を示します。
- Mutagenicity
- Carcinogenicity
- Chromosome damage
- Genotoxicity
- Hepatotoxicity
- hERG channel inhibition
- Teratogenicity
- Thyroid toxicity
- Skin sensitization
- Irritation
- Respiratory sensitization
- その他
Derek for Windowsのメリット
- Windowsデスクトップスタンドアローンシステムであり操作が容易であるため、どの領域の研究者でもすぐにお使い頂くことができます。
- 合成段階での潜在的毒性の検出、安全性試験の優先順位付け等に利用することで、より早期段階での毒性プロファイリングが可能となります。
また、開発初期段階での遺伝毒性不純物の毒性評価においても利用実績がございます。 - 毒性予測の根拠(知識ベース)が全て開示されており、毒性予測結果の吟味が可能です。
- 自社化合物に対する予測精度を向上させるために、ご購入企業様オリジナルの毒性予測ルールを設定することができます。
- Lhasa Limited社主催によるユーザ会が開催され、今後の毒性予測ルール開発に関する意見交換を行う機会がございます。
図:毒性予測結果の表示、および、毒性予測ルールの参照
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Meteorは、化合物の構造からその代謝反応および代謝産物を予測する知識ベース(Knowledge Base)のエキスパートシステムです。
Meteorは、多くの知見から得られる化合物の部分構造と代謝反応の経験則を定義した知識ベースにより、定性的代謝予測を行います。
化合物の構造をISIS/DrawまたはMol・SDファイルからインポートすることで、容易な操作により代謝経路・代謝反応を予測することができます。同時に、その代謝予測の根拠になった構造部位を提示し、予測された代謝経路をリファレンスとして参照することができます。予測結果は、代謝反応と代謝物を検出します。
また、個々の代謝反応の確からしさや競合反応間の優先順位、代謝反応ルールに関連する既知の代謝反応に関するリファレンス・実験データも参照することができます。
Meteorで用いられている知識ベースは、ユーザに公開されており、現在418種の代謝反応ルールが収録されています。
代謝反応予測を行う化合物の構造入力
Meteorのメリット
- Windowsデスクトップスタンドアローンシステムであり操作が容易であるため、どの領域の研究者でもすぐにお使い頂くことができます。
- 合成段階において、代謝を受ける部分構造の抽出・質量分析データ解析における候補化合物の代謝物同定における利用実績がございます。
- 代謝反応予測の根拠(知識ベース)が全て開示されており、代謝反応予測結果の吟味が可能です。
- 自社化合物に対する予測精度を向上させるために、ご購入企業様オリジナルの毒性予測ルールを設定することができます。
- Lhasa Limited社主催によるユーザ会が開催され、今後の代謝反応予測ルール開発に関する意見交換を行う機会がございます。
図:代謝反応予測結果の表示、および、代謝反応予測ルールの参照

