印Ocimum社(米Gene Logic)は、創薬におけるターゲット探索や安全性分野を強力に支援する遺伝子発現解析のリーディングカンパニーです。ヒトおよび実験動物等のサンプルから得た豊富な遺伝子発現解析データや遺伝子発現解析サービスを提供しています。
創薬研究においてヒト組織サンプルから得た遺伝子発現情報は重要な情報資源となります。しかし、ヒト組織サンプルの網羅的収集は困難である、パブリックデータはプロトコル不統一等の問題により活用の幅に制限がある、膨大な生データから付加価値の高いデータベースを構築するにはコストがかかるといった課題があります。 これら課題に対するソリューションが遺伝子発現情報リファレンスデータベースASCENTAです。
遺伝子発現情報リファレンスデータベース ASCENTA は、ヒトおよび実験動物の組織や培養細胞サンプル等の遺伝子発現データから構築された、データベースです。
ウェブブラウザから簡単に遺伝子や疾患に関する遺伝子発現情報を検索・解析することができ、文献等関連情報も参照可能です。
ASCENTAの特長
- 心血管系、中枢神経系、腫瘍、免疫、炎症系、代謝といった主要な疾患領域に幅広く対応
- ターゲット／バイオマーカー探索、評価における意志決定を支援
- 病理学者および分子生物学者によってクラス分け、アノテーションされた付加価値の高いデータセット
- ヒトに加えて、実験動物や培養細胞のサンプルのデータを収録
- 9000以上のサンプルの遺伝子発現データから約1,500のデータセットを構築済み
- ウェブブラウザで検索・閲覧でき、複雑な操作の習得は不要
創薬研究の意思決定を支援する有用情報にウェブブラウザからアクセス可能
注目遺伝子の各組織における発現量、注目する疾患における遺伝子変動、注目サンプルにおいて特異的に変動している遺伝子、注目遺伝子と変動パターンが類似している遺伝子といった有用情報がウェブブラウザを使ったシンプルな操作で閲覧できます。また、各遺伝子に付随する機能・特長などの基本情報は定期的に更新され、各サンプルには画像、病理所見といった情報が掲載されており、効率的な情報閲覧ができます。
図：ASCENTA検索画面
図：発現変動情報
図：サンプル情報のサンプル
