Proteros biostructuresは、細菌の膜タンパクの解析に成功し、ノーベル賞を受賞したDr. Huberらが設立したドイツの企業です。タンパクの発現、精製、結晶化、X線構造解析まで一貫したサービスを提供しており、これまで30社以上の医農薬企業、バイオテック企業からの受注実績があります。
タンパクの発現系の構築、結晶化条件探索、複合体創製および構造決定まで一括して行うサービスです。
Gallery Structuresサービス
以下に挙げるタンパクとお客様の化合物との複合体を作成し、分子構造を解析するサービスです。
個々のタンパクにおける、発現、結晶化、リガンドとの複合体創製といった各種手法は、Proterosが確立済みのため、迅速で高精度な解析が可能です。
サービス開始（化合物をProterosに送付）から解析完了（複合体の原子座標算出）まで概ね4～8週間というスピーディなサービスを提供します。
Kinases
ACK
Aurora A
Aurora B
B-Raf
BTK
c-Abl
c-Kit
c-Met
CDK2
EGF-RK
EphB4
ERK2
FAK
Flt3
Glucokinase
GSK3 β
IGF1-RK
IRAK-4
JAK-2
JAK-3
MAPKAP-K2
MEK 1
MEK 2
NEK 2
PAK 1
PAK 4
PI3K γ
PIM-1
PKA
PKB α / AKT1
PKC iota
PKC theta
PLK1
PLK4
ROCK 1
ROCK 2
Src
Syk
TAK 1
Tie 2
Proteases
BACE
Calpain
Caspase 1
Cathepsin B
Cathepsin K
Cathepsin L
DPP IV
Elastase
Factor VIIa
Factor IXa
Factor Xa
Factor XIa
HCV NS3/4A Protease
HIV Protease
MMP9
MMP13
Proteasome
Thrombin
Urokinase
Others
11-β-HSD-1
Acetyl-CoA Carboxylase2
Bcl-XL
HCV NS5A Domain I
HCV NS5B Polymerase
HIV Reverse Transcriptase
HSP90
KSP / EG5
LXR α
LXR β
PDE2A
PDE4A
PDE4B
PDE4D
PDE7A
PDE10A
PPAR γ
HSA
製薬企業と共同開発した独自ライブラリを用いて、お客様の指定するタンパクに結合するfragmentを同定するとともに、その後fragment evolution等の手法を用いてリード化合物を創出するサービスです。 まずreporter displacement assayによりfragmentを絞り込み、その後X線解析を行います。
欧米の製薬企業で経験を積んだmedicinal chemistがdrug designを行います。
独自技術：PicoDropper™タンパク-リガンド複合体の創製
タンパク結晶にPico単位でリガンドDMSO溶液を滴下し、複合体を創出します。Pico単位でリガンド溶液を滴下することでタンパク結晶の破壊を防ぎます。
DMSOを用いるため、solubilityやaffinityの低いリガンドやfragmentに対して特に有効な手法です。
Proterosが独自に設計したreporter probeと、お客様の化合物とを競合させてKd値, Koff値およびKon値の測定を行いサービスです。 下記のGallery Assayに挙げているタンパクに関してはreporter probeを設計済みですので迅速な測定サービスが行えます。
Gallery assay：実験系を確立済みのタンパクリストであり、高精度で迅速なサービスを提供します。
Abl
ACK
ALK
B-Raf
BTK
CDK2/CycA
CDK7/CycH/MAT1
CDK9/CycT
c-Kit
c-Met
c-Raf
CLK1
DDR1
DDR2
EphA2
EGFR
EGFR(L858R)
EGFR(T790M)
EGFR(T790M L858R)
EphA1
EphA2
ERK5
FAK
FER
FLT3
FLT3(D835Y)
GSK3α
GSK3β
IRAK4
JAK2
JAK3
JNK1
JNK2
LRRK2
MAP3K1 (MEKK1)
MAPK2-Erk2 (inactive)
MEK1 (inactive)
MLCK (MLCK2, MYLK3)
MNK1
MUSK
mTOR
MYLK
MYLK2
NLK
p38α (active)
p38α (inactive)
p38β
PAK1
PDGFRα
PDGFRβ
PKCalpha
PKCtheta
ROCK2
RON
ROS
SYK
TAK1-TAB
TAOK3
Tie 2
VEGFR2
ZAK
PI3Kα/p85α
PI3Kβ/p85α
PI3Kγ
PI3Kδ/p85α
PDE2a
PDE4D2
